Protein Alignment

 

 

 

 

         10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270

  ....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|
CHI -MATPGASSARDEFVYMAKLAEQAERYEEMVEFMEKVAK-AVDKDELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESRGNDDHVSLIRDYRSKIETELSDICDGILKLLDTILVPAAAS-GDSKVFYLKMKGDYHRYLAEFKSGQERKDAAEHTLTAYKAAQDIANSELAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACNLAKQAFDEAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQDDVA-DDIKEAAPAAAKPADEQQS----
OMEGA ------MASGREEFVYMAKLAEQAERYEEMVEFMEKVSA-AVDGDELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESRGNDDHVTAIREYRSKIETELSGICDGILKLLDSRLIPAAAS-GDSKVFYLKMKGDYHRYLAEFKTGQERKDAAEHTLAAYKSAQDIANAELAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACNLAKQAFDEAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQDDAA-DEIKEAA--APKPTEEQQ-----
PSI -------MSTREENVYMAKLAEQAERYEEMVEFMEKVAK-TVDVEELSVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESKGNEDHVAIIKDYRGKIESELSKICDGILNVLEAHLIPSASP-AESKVFYLKMKGDYHRYLAEFKAGAERKEAAESTLVAYKSASDIATAELAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACSLAKQAFDDAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMTDEAG-DEIKEASKPDGAE----------
PHI MAAPPASSSAREEFVYLAKLAEQAERYEEMVEFMEKVAE-AVDKDELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESRGNDDHVTTIRDYRSKIESELSKICDGILKLLDTRLVPASAN-GDSKVFYLKMKGDYHRYLAEFKTGQERKDAAEHTLTAYKAAQDIANAELAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACNLAKQAFDEAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQDESP-EEIKEAA--APKPAEEQKEI---
UPSILON ----MSSDSSREENVYLAKLAEQAERYEEMVEFMEKVAK-TVETEELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEDSRGNSDHVSIIKDYRGKIETELSKICDGILNLLEAHLIPAASL-AESKVFYLKMKGDYHRYLAEFKTGAERKEAAESTLVAYKSAQDIALADLAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSSDRACSLAKQAFDEAISELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDLNDEAG-DDIKEAPKEVQKVDEQAQPPPSQ
LAMBDA ----MAATLGRDQYVYMAKLAEQAERYEEMVQFMEQLVTGATPAEELTVEERNLLSVAYKNVIGSLRAAWRIVSSIEQKEESRKNDEHVSLVKDYRSKVESELSSVCSGILKLLDSHLIPSAGA-SESKVFYLKMKGDYHRYMAEFKSGDERKTAAEDTMLAYKAAQDIAAADMAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSSDKACNMAKQAFEEAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQEQM--DEA--------------------
NU ------MSSSREENVYLAKLAEQAERYEEMVEFMEKVAK-TVDTDELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESRGNDDHVSIIKDYRGKIETELSKICDGILNLLDSHLVPTASL-AESKVFYLKMKGDYHRYLAEFKTGAERKEAAESTLVAYKSAQDIALADLAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACSLAKQAFDEAISELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWNSDINDEAGGDEIKEASKHEPEEGKPAETGQ--
KAPPA ----MATTLSRDQYVYMAKLAEQAERYEEMVQFMEQLVSGATPAGELTVEERNLLSVAYKNVIGSLRAAWRIVSSIEQKEESRKNEEHVSLVKDYRSKVETELSSICSGILRLLDSHLIPSATA-SESKVFYLKMKGDYHRYLAEFKSGDERKTAAEDTMIAYKAAQDVAVADLAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSSEKACSMAKQAFEEAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQEQM--DEA--------------------
MU ----MGSGKERDTFVYLAKLSEQAERYEEMVESMKSVAKLNV---DLTVEERNLLSVGYKNVIGSRRASWRIFSSIEQKEAVKGNDVNVKRIKEYMEKVELELSNICIDIMSVLDEHLIPSASE-GESTVFFNKMKGDYYRYLAEFKSGNERKEAADQSLKAYEIATTAAEAKLPPTHPIRLGLALNFSVFYYEIMNAPERACHLAKQAFDEAISELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDISEEGG-DDAHKTNGSAKPGAGGDDAE---
EPSILON ------MENEREKQVYLAKLSEQTERYDEMVEAMKKVAQLDV---ELTVEERNLVSVGYKNVIGARRASWRILSSIEQKEESKGNDENVKRLKNYRKRVEDELAKVCNDILSVIDKHLIPSSNA-VESTVFFYKMKGDYYRYLAEFSSGAERKEAADQSLEAYKAAVAAAENGLAPTHPVRLGLALNFSVFYYEILNSPESACQLAKQAFDDAIAELDSLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDLNEEGDERTKGADEPQDEN-----------
OMICRON ------MENERAKQVYLAKLNEQAERYDEMVEAMKKVAALDV---ELTIEERNLLSVGYKNVIGARRASWRILSSIEQKEESKGNEQNAKRIKDYRTKVEEELSKICYDILAVIDKHLVPFATS-GESTVFYYKMKGDYFRYLAEFKSGADREEAADLSLKAYEAATSSASTELSTTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPERACHLAKRAFDEAIAELDSLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDLEE-GGK-----------------------
IOTA -MSSSGSDKERETFVYMAKLSEQAERYDEMVETMKKVAR--VNS-ELTVEERNLLSVGYKNVIGARRASWRIMSSIEQKEESKGNESNVKQIKGYRQKVEDELANICQDILTIIDQHLIPHATS-GEATVFYYKMKGDYYRYLAEFKTEQERKEAAEQSLKGYEAATQAASTELPSTHPIRLGLALNFSVFYYEIMNSPERACHLAKQAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDLPEDGG-EDNIKTEESKQEQAKPADATEN-
PI ------MENEREKLIYLAKLGCQAGRYDDVMKSMRKVCELDI---ELSEEERDLLTTGYKNVMEAKRVSLRVISSIEKMEDSKGNDQNVKLIKGQQEMVKYEFFNVCNDILSLIDSHLIPSTTTNVESIVLFNRVKGDYFRYMAEFGSDAERKENADNSLDAYKVAMEMAENSLAPTNMVRLGLAL